안녕하세요. 저도 처음에 bms 셀 설정할 때 21700-40t가 목록에 없어서 헤멨던 기억이 나는데요, 2년 전이라 기억이 가물가물하지만 아마 그런 pre-defined list가 아니라 그냥 직접 셀 설정 입력해서 사용했던 것 같아요.
1번은 셀 내부저항 부분 말씀이신 것 같은데 셀 데이터시트에 보시면 아마 적혀있을 거에요. ¼. 시스템 설계 가이드 - 대학생 자작자동차대회 E-Formula 전기시스템 제작기 의 퓨즈 선정에 관한 팁 부분에 있는 이미지도 삼성 21700-40T 데이터시트였던 걸로 기억하는데 찾아보시면 될 것 같아요. 설정하실 때 팩 직/병렬 수 고려하셔야 했던 것 같구요. 입력하시려는 부분 스크린샷을 올려주시면 기억이 더 잘 나지 않을까 싶네요 
2번은 bms 말고 별도의 soc 데이터로거를 사용한다는 말씀이시죠? 저희가 썼던 건 Data Logging Display | Orion Li-Ion Battery Management System 이건데 아마 비슷한 종류의 것이지 않을까 싶네요. 일단 bms는 soc를 제대로 읽는데 데이터로거에서만 안 나오는 것인지를 명확하게 해야 할 것 같은데요, bms utility에서는 soc가 제대로 표시되나요?
일단 soc 자체는 전류가 흐르지 않아도 나오기는 합니다. 에러 표시등이 들어온다고 말씀하신걸 보니 저는 단순히 CAN 문제일 것 같은데요, 이 부분 먼저 한 번 확인해 보셔도 좋을 것 같아요.